一般不是特别痛苦。因为在做牙龈囊肿手术的时候,会注射**药物,并不会给身体带来巨大的痛苦,但是在**药物过后有可能会导致局部出现疼痛的情况,如果疼痛感比较剧烈的话,可以在医生的指导下采取消炎镇痛的药物治疗。若是患有牙龈囊肿可能会导致牙龈出现肿胀以及疼痛的情况,在患上牙龈囊肿后要及时治疗,避免影响到口腔健康。