囊肿和脓肿两者的区别应该就是在于一个是局部的炎性反应,而且囊肿一般可能会发生在肠道里面,或者是乳腺囊肿的一种表现,囊肿在治疗时,一般需要手术切除的方法来治疗的。脓肿需要服用抗感染和抗病毒的药物,同时还可以在局部涂抹消炎跟抗病毒的药膏来治疗的。