粪肠球菌可以用青霉素类、氨基糖苷类抗生素治疗。由于粪肠球菌是比较常见的致病菌,要做病原菌的实验检查确诊后进行治疗,粪肠球病菌普遍存在耐药性,通过一种抗生素治疗效果不太明显,所以在治疗时会结合两种抗生素进行治疗。通常使用的是青霉素类的药物配合氨基糖苷类抗生素治疗为主。