黄芩的主要作用是清热除湿、泻火解毒、止血。用于湿、热、胸闷、呕吐、湿热饱、腹泻、黄疸、肺热咳嗽、高热口渴、血热呕吐、痈肿肿痛毒素、胎动不安。主要用于治疗发热、上呼吸道感染、肺热咳嗽、湿热黄疸、肺炎、痢疾、咯血、眼红、胎动不稳、高血压、痈疮、疖疮等疾病。黄芩的临床应用优于黄连,且不产生耐药性。具有广谱抗菌作用的特点,对真菌培养中的杂菌感染尤为严重。黄芩苷提取物效果很好。