剪指甲长肉里肿了化脓可以在医生的指导下应用抗生素的药物进行治疗,另外也可以使用碘伏进行消毒,如果化脓比较严重的话,也可以采取切开引流的方法进行治疗。如果指甲长肉里了而且有化脓的情况,可能是患上了甲沟炎所引发的,一般会导致局部出现疼痛以及肿胀的情况,而且还有可能会影响到行走。