三个月胎儿彩超一般不可以查出胎儿畸形。因为在怀孕三个月的时候,胎儿发育还没有完全成型,所以是检查不出胎儿是否存在畸形现象,最好到怀孕15周的时候进行唐氏筛查,能够排除胎儿畸形。女性在怀孕期间,需要适当的吃富含叶酸的水果和蔬菜,也能够预防胎儿出现畸形。