生物素的最常见副作用是在下颚和下巴上爆发囊肿性痤疮。不过每个人经历的情况各有不同。危及生命的副作用很罕见,唯一有记录的案例是一位女性在服用生物素后出现嗜酸性粒细胞的胸膜心包积液,这是一种涉及肺和胸腔的危险疾病。她当时与维生素b5一起摄入大量生物素。不过在停止服用这两种维生素后恢复了健康。