三岁宝宝刷牙不干净可能是口腔卫生引起的,也可能是宝宝的刷牙方法不正确导致的,但是也不排除是某些物质造成的。平时要引导孩子每天定时刷牙,而且还要教给孩子正确的刷牙方法,以免食物残渣存在牙齿上导致牙齿变黄,如果宝宝的牙齿发黄比较严重,需要到正规医院的**,进行超声波洗牙。