一般是不会有后遗症的,如果病情较重的话,也可能会留下后遗症。新生儿脑炎一般是由于免疫力低下的原因导致的,那可能是由于感冒的原因引起的,所以一定要及早的进行治疗,通常可以减少后遗症的情况。宝宝在出生以后,由于免疫力比较低下,平时应给宝宝做好护理工作,尽量避免宝宝出现感冒的情况。