有霉菌做药流的后果有可能会导致细菌感染到宫腔,从而引起宫腔感染,可能会引起宫颈炎,或者是子宫内膜炎,并且还会引起盆腔炎等疾病的发生,因此在做流产之前,最好可以到医院做一下妇科检查,然后再配合医生用药,在病情稳定以后进行流产。流产一般可以选择药物流产或者是无痛流产。