有可能会导致胎儿畸形,因为补充孕酮就会增加体内孕酮量,是孕期的一种激素,不可以补充太多,否则会显示孕激素增高。在补充孕酮的时候应该听从医生指导,选择合适剂量和疗程定期到医院进行检查,看一下是否恢复。如果孕酮过低也会导致先兆流产发生,在怀孕早期也可以口服叶酸,预防胎儿神经管畸形。