一般是不用处理的,巧克力囊肿是由于子宫内膜异位原因导致的,来月经的时候会导致内膜出血,长时间出血之后就会形成囊肿,如果囊肿较小,大多会随着绝经之后慢慢吸收。但是如果囊肿的直径比较大,超过了5厘米,一般是不能自行吸收的,需要去医院做详细的检查之后,通过手术的方法进行去除,并且手术之后还要定期复查。