巧囊超声穿刺有可能会引起感染的副作用,也可能会引起盆腔粘连的现象,在做穿刺的时候可能会有液体流在盆腔里,所以就很容易引起感染,而且在穿刺的过程中,也可能会引起局部出血的现象,甚至会出现复发的可能。巧囊也就是巧克力囊肿,主要是子宫内膜移位引起,一般情况下在做巧克力囊肿穿刺时,不会带来明显的副作用。