巴戟天的副作用一般会引起小便不利、眼痛眼红、便秘以及烦躁等症状。婴幼儿对药物敏感或体质较弱,巴戟天有一定毒素,婴幼儿不宜服用。孕妇也不宜服用此药品,服用后药的成分会传至子宫,从而直接影响胎儿健康。巴戟天的营养价值虽然很高,但是在食用时也一定要注意。