电学生理检查需要将导管插入体内,属于一种“侵入性”检查。这样做有一定的风险,但这些风险都很小,因此电生理学检测比较安全。一些病人在插入导管(腹股沟或手臂)时会出血并皮下血肿,导致局部肿胀和/或瘀斑。几乎没有电生理检查能引起更严重的并发症,包括心脏或血管损伤、血栓和感染。病人死亡更为罕见。尽管大部分电生理检查没有并发症,但要清楚这些风险的存在。