一般是不能自愈的。新生儿代谢病通常是遗传因素所引起的,所以自愈的几率相对会比较小,在发病时,孩子的身体以及智力会受到比较严重的损伤,需要及时的进行检查来预防病情发生。如果确诊出现了新生儿代谢异常,可以在医生的指导下来服用对应的药物或者是通过手术方式来进行治疗。