怀孕46天有褐色的分泌物有可能是先兆流产导致。在怀孕的早期,胎儿着床不是特别稳定,如果太过度的劳累或者是有性生活的情况下,都会出现子宫收缩,从而引起先兆流产,要尽早去医院做检查,并配合医生用**药物能够达到保胎的目的。期间要严格的卧床休息,还要注意补充营养。