大活络丸和小活络丸的区别是功效不同,大活络丸主要具有通络化痰的作用,并且还能够起到活血止痛功效,主要能够治疗风湿性关节炎以及关节屈伸不利。小活络丸的功效是理气化痰和舒经活络,能够治疗脑血管疾病所引起的后遗症,对于病情所引起的偏瘫,也能够起到改善效果。