补牙包括窝洞准备和填充两个步骤,在窝洞准备时,首先要清除病变组织,然后对窝洞进行消毒工作。根据您所描述的,医生在您的牙洞里塞了棉花,应该就是为了消毒。补牙塞棉花是起到一个消毒的作用,另外就是可以清洁牙洞里的腐蚀物,为后续工作做准备。您要根据医生的安排,按时道医院取出塞在牙洞里的棉花,然后看是否需要进行二次消毒。