婴儿先天性巨结肠、新生儿单纯性胎儿粪便、先天性肠闭锁和狭窄、先天性肠旋转不良和先天性**门直肠畸形均可导致婴儿肠梗阻。这些疾病的病因可分为三个方面:第一,环境因素,包括出生前(宫内)、出生时和出生后的所有非遗传因素。第二,遗传因素。第三个因素是,一些相关的组织发育障碍也会导致疾病。病毒感染或其他环境因素也可能在母亲怀孕早期引起相关的组织和器官发育障碍。