扁平疣不同阶段的颜色是不同的,早期,也就是一到两年内,呈现面积小,颜色接近皮肤的颜色或者有点深色;到了中期的时候,面积会逐渐加大,颜色会加深,呈现咖啡色,中期时段有三到六年的时间;到了六年及以上时间,扁平疣色泽会变成灰褐色,而且表皮会加厚。